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Biotecnología


Determinan la secuencia del genoma de la soya Palaeopoliploide (Glycine max)

Por
Jun 25, 2010, 15:06

Jeremy Schmutz investigador del Centro Hudson Alpha Genome Sequencing con sede en Alabama, Estados Unidos y un equipo de 45 investigadores del ARS (Agriculture Research Service), del USDA (United States Department of Agriculture) y de 18 organizaciones más, lograron determinar la secuencia del genoma de la soya. La metodología y datos finales fueron publicados el pasado mes de enero en la revista Nature en donde, además de la información científica se destaca la importancia de la soya (Glycine max) como una de las plantas leguminosas de mayor valor económico, nutricional y ecológico del momento por sus semillas ricas en proteína y aceite y por su capacidad para mejorar los suelos a partir de la simbiosis que mantiene la planta con el nitrógeno atmosférico y con los microorganismos del subsuelo.

Después de quince años de trabajo, el equipo de investigadores logró la secuenciación “disparo-total del genoma” con una aproximación del 85% de los 1.1. mil millones de pares de bases de nucleótidos que forman el código entero de ADN de la soya. La secuenciación e integrarlo en mapas genéticos físicos de alta densidad para ensamblar y delinear la secuencia del cromosoma. Los investigadores lograron predecir 46,430 genes de proteína codificada, 70% más que el arabidopsis que es similar al genoma y que, al igual que el de la soya, es un poliploide (palaeopoliploide). Cerca del 78% de la predicción de los genes tuvieron lugar al final de los cromosomas, que abarcan menos de la mitad del genoma, pero llega a sumar cerca de la totalidad de la recombinación genética.

Las duplicaciones del genoma se generaron en fechas que oscilan entre los 59 y los 13 millones de años aproximadamente como resultado de la alta capacidad de duplicación del genoma en múltiples copias hasta llegar a cerca del 75% de los genes presentes. Por mucho tiempo continuaron los eventos de dos de las duplicaciones debido a la diversificación y pérdida de genes y el re-arreglo de numerosos cromosomas.

La precisión de la secuencia del genoma facilitará la identificación de la base genética de muchas de las características de la soya y de otras leguminosas que permitirá la rápida creación y mejoramiento de nuevas variedades. Esta nueva información sobre la composición genética de la soya podrá acelerar el rendimiento del cultivo por hectárea, el desarrollo de plantas de soya que produzcan semillas con mayor contenido de proteína y de aceite, semillas con mayor capacidad para adaptarse a las condiciones ambientales adversas mayor resistencia a la sequía y las enfermedades.

(Fuentes: “Genome Sequence of the Palaeopolyploid Soybean” Nature, vol. 463/14 Jan. 2010/doi:10.1038/Nature 08670; “USDA Scientists, Cooperators Sequence Soy Genome”, USDA News Release http://www.usda.gov Jan. 2010).

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